朱翊鈞聽了，臉色嚴肅。申時行接著道：“因此，臣等議論的雖是翰林院興革，但因為事關政事堂的產生以及諸相任免——”
朱翊鈞腰身在御座上挺直了，剛才停筆聽申時行奏對的太子也目光炯炯的看著自己的父皇，聽申時行接著道：“內閣與後來的政事堂之設，類漢唐之尚書省，間隔皇帝與六部，所謂總彙樞機者——我朝翰林學士之任命，乃天子欽點，與外朝會推無干。而所謂“非翰林不入閣”，其本質是將內閣諸相的任命權置於君權之下，此乃祖宗強化君權之法也，此乃‘事關根本’者一。”
朱翊鈞點頭稱是，太子已經聽得呆了，小臉已經皺了起來。申時行接著奏道：“因皇上經筵侍講、東宮侍讀者皆為翰林，所謂‘天子近臣’也，翰林在侍講、侍讀過程中，已經得到了信重，自然在從政後位高權重......此為事關根本者二。”
申時行接著道：“此前翰林最高不過五品，朝廷設立遷轉之階無非兩京國子監、詹事府等職，途徑狹窄。祖宗之意仍是將‘儲相’們多多的考察磋磨，非有大毅力耐心者不得快速晉升，仍為選材之法。如今既然‘宰相起於州郡’，庶吉士、翰林外放仍比三甲進士起步高許多。因此朝廷館選，進士們仍趨之若鶩。”
朱翊鈞點頭道：“先生們議論的是。那改革之策如何？”
申時行定神道：“政事堂以為，此番翰林院改革，有兩個方向，擬請聖裁。”
“一是改翰林院回秘書本職，此後不再館選庶吉士，將翰林院與侍從室合併，改名秘書檯，內設檔案館、蘭臺院、秘書處三個機構，分別負責檔案、典籍整理、詔書制發、調查研究等，為皇上所用的專門秘書機構。”
朱翊鈞聽罷，眉頭微皺，等申時行說第二條。申時行沒看皇帝的表情，只接著奏道：“第二個方向則改動較大，秉承皇上將翰林院‘從禮部獨立出來’並‘復興華夏真道統’的旨意，臣等以為——”
頓了頓並輕咳一聲，他接著回奏道：“可以將翰林院的秘書職能全部剝離到侍從室，廢國子監並改翰林院為太學院，為專門的歷史研究、道統辯處、政策調研、檔案整理、經筵侍講的機構。”
朱翊鈞聽了面色稍霽，聞言點頭道：“從政事堂之設及諸相選拔制度的改革現狀來看，翰林院確實並無保留的必要。侍從室可以改名為侍從處，將詔書制發職能拿到政事堂，侍從處用寶。其餘的按剛才奏報的形成詳細方案，徵求朝野意見。”
申時行先吃了一驚，隨即心念電轉，低頭回奏道：“是。”
皇帝接著點評道：“變法前翰林學士作為皇帝秘書制詔，根本仍是將皇帝與朝廷對立。設若上下同欲，制詔不過文書工作而已。若上下不同欲，皇帝頒詔只會撕裂朝廷，倖進之徒不免從中取利，煽動紊亂朝綱——太子，此中道理可明白？”
太子將筆放下，束手恭敬答道：“皇兒明白。凡大政之出，必先朝野達成一致方可頒行。”
朱翊鈞臉上露出笑容，讚道：“太子最近長進頗大。”太子小臉漲的通紅，嘴角咧起來壓不住。
朱翊鈞隨即轉向申時行道：“你們提出的第一個方案廟算不遠，若秘書檯立起來，將來不免與政事堂爭權——中興郡王所留下的‘政令混一’之局面不免毀於一旦。你們或覺‘異論相攪’之心可以稱旨，其實是想多了。”
申時行額頭見汗，低聲奏道：“皇上如今春秋鼎盛，為將來計，未必後世子孫皆如陛下之聖之明......若此。”
朱翊鈞哂笑道：“若後世子孫不肖，還不如以政事堂治天下！”頓一頓又道：“本朝最好把皇帝該乾的事情幹好，將來留下一個洪業長傳的好法度——先生，其勉之！”
申時行面色也漲紅起來，呼吸粗重道：“敢不奉詔！”
此時君臣對話已經到頭，殿內靜了一會兒。
見皇帝露出疲憊之色，旁邊的太監遞上一塊擦臉巾，熱氣騰騰的，朱翊鈞接過來放在臉上覆著，舒服的嘆了口氣。
過了一小會兒，皇帝拿下那塊手巾對申時行笑道：“瑤泉先生，這是針織法結合漳絨技法做的毛巾，朕幼年時，嫌棄綢巾滑不吸水，棉巾粗劣，讓內務府遍尋巧匠，做一種有絨圈的‘毛巾’，苦尋十餘年。——朕手上這塊，已在批次生產了。”
申時行不明所以，嘴上接話道：“臣不知皇上在找這種東西，臣幼年在徐家見過此物，確稱‘漳絨’不假。還有一種絨花緞子底的，都用作衣料，用來做面巾卻少見——如今想來，這東西做手巾面巾，吸水又柔軟，確實恰好。”
皇帝聞言甚喜，卻搖頭笑道：“非也，先生不知細節。漳絨雖柔軟，卻失於綿密，料子也只能做衣服和簾布，唯有針織法才能織出來這麼疏密恰當的料子......”吩咐道：“拿一塊新的給先生看看。”
侍者聞言，忙將沒有浸溼的新毛巾拿了一塊，走下陛前，躬身遞到申時行手中。申時行低頭接過，觸手果然綿軟厚實，本來手心有點汗溼，一握隨即感覺乾爽，看著那一圈圈的‘圈絨’笑道：“此物甚妙！擦汗拭面，不做他選也——與葛布比，只恐靡費人工，太奢侈了。”
皇帝聞言哈哈大笑：“此物先生覺得拿多少錢買來合適？”
申時行沉吟一下：“若半龍元一塊，臣家就都用此物了。”
皇帝在御座上笑的酣暢：“哈哈！先生手中一塊，成本五十文——若工藝再改進些，二、三十文也能得。”嘆口氣道，“此物若全國鋪開，數以萬計的女子就可以以之貼補家用了。”
申時行忙躬身頌聖道：“皇上以格物一道化育天下，所好者無奢侈無用之物，都是能進入尋常百姓之家的......這個.......‘產品’，厚培民生，天下之幸也。”
皇帝聞言，正色道：“先生提醒的是，朕並不敢向奢靡而廢國事。”隨即對申時行道：“朕此前命各地集中巧匠製作的一件機器，未曾想南京這邊先拔了頭籌......此物非同小可，朕此番留在南京，泰半為此，你我君臣先墊墊肚子，等一會兒我帶你與太子一同去看。”
隨即嘆道：“此物若鋪開了，將來生產這塊毛巾不過一、兩文而已......”